Bei der regelmäßigen Archivbereinigung werden gelöschte Archive entfernt und die Integrität des Archivs überprüft. Wenn eine Datei im Tresor gelöscht oder endgültig gelöscht wird, wird die Historie dieser Datei aus der Tresordatenbank entfernt. Der physische Archivordner verbleibt so lange auf dem Server, bis die Bereinigung durchgeführt wird. Standardmäßig wird die Bereinigung jede Nacht um 3 Uhr für alle auf dem Archivserver gespeicherten Tresorarchive gestartet.